自2003年8月14日经卫生部颁布了（医疗卫生机构医疗废物管理办法）后，结合医院实际情况，在全院范围内，由感染管理科组织开展了一系列院内的医疗废物管理、分类、收集、规范处置的培训，使全院的医护人员掌握了医疗废物的管理、分类收集、规范处置。同时针对不同的科室分别进行了指导。
各科室严格按照医疗垃圾分类进行收集，每个科室收集医疗垃圾的地方都有图文并茂的医疗垃圾处置流程；
按分类分别用有明显标识的医疗垃圾桶进行收集；医院还设置医疗垃圾暂存间，有明显的防火、防蝇、防鼠的标识；
医院有专人对医疗垃圾进行收集、管理，每天定时到各科室收集医疗垃圾，转运到暂存间保存，同时和楚雄亚太医疗废物有限公司签订协议，将所有的医疗废物统一交给该公司进行处理，避免了医疗废物的外泄引起的不良反应。
为加强医疗废物的管理，医院定期组织医疗废物泄露应急演练,提高医疗废物泄露应急处置的能力，防止医疗废物意外泄露后造成环境污染、人员伤亡以及疾病的发生及传播。不断提高医院各科感控能力，同时加大对各科室的考核力度，做到月月月奖惩、月月有提高，树立了全院的感控意识，真正做到“感控工作无小事”。
